Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd2Q9Z2E1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd2Q9Z2E1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms