Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn7Q9Z261 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn7Q9Z261 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms