Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D17h6s53eQ9Z1R4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms