Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp4Q9Z1N6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1052.7 ms