Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx39bQ9Z1N5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms