Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Padi1Q9Z185 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Padi1Q9Z185 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms