Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Hmg20bQ9Z104 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms