Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NgfrQ9Z0W1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NgfrQ9Z0W1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms