Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp46a1Q9WVK8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms