Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp1a4Q9WV27 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp1a4Q9WV27 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms