Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srd5a3Q9WUP4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srd5a3Q9WUP4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms