Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skp1Q9WTX5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms