Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trex2Q9R1A9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms