Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Atp2b2Q9R0K7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atp2b2Q9R0K7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2b2Q9R0K7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms