Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf346Q9R0B7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf346Q9R0B7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms