Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms