Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndrg3Q9QYF9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms