Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp3Q9QY23 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms