Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY9

Pex3, Peroxisomal biogenesis factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex3Q9QXY9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pex3Q9QXY9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms