Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk1nQ9QXV0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk1nQ9QXV0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk1nQ9QXV0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk1nQ9QXV0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk1nQ9QXV0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms