Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip3Q9QXT8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms