Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg2Q9QXK3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg2Q9QXK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg2Q9QXK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg2Q9QXK3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg2Q9QXK3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg2Q9QXK3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg2Q9QXK3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Copg2Q9QXK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copg2Q9QXK3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms