Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apbb1Q9QXJ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apbb1Q9QXJ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms