Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaja4Q9JMC3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms