Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gkap1Q9JMB0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms