Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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