Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Msrb1Q9JLC3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msrb1Q9JLC3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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