Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ldb3Q9JKS4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ldb3Q9JKS4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms