Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms