Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nectin1Q9JKF6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms