Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJB9

Tmem183, Transmembrane protein 183, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem183Q9JJB9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmem183Q9JJB9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmem183Q9JJB9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmem183Q9JJB9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmem183Q9JJB9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmem183Q9JJB9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmem183Q9JJB9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmem183Q9JJB9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmem183Q9JJB9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmem183Q9JJB9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem183Q9JJB9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms