Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssna1Q9JJ94 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssna1Q9JJ94 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms