Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ercc6l2Q9JIM3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ercc6l2Q9JIM3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6l2Q9JIM3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms