Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prmt1Q9JIF0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prmt1Q9JIF0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prmt1Q9JIF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prmt1Q9JIF0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms