Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms