Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp29Q9ES63 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp29Q9ES63 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp29Q9ES63 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp29Q9ES63 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp29Q9ES63 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp29Q9ES63 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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