Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sall1Q9ER74 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall1Q9ER74 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms