Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn2Q9ER65 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Clstn2Q9ER65 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn2Q9ER65 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms