Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mrpl4Q9DCU6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms