Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ap3s1Q9DCR2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms