Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eif3fQ9DCH4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 277.1 ms