Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scp2d1Q9DAH1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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