Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc1Q9D9T8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc1Q9D9T8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc1Q9D9T8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc1Q9D9T8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc1Q9D9T8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc1Q9D9T8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms