Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G3

Chic2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic2Q9D9G3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chic2Q9D9G3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Chic2Q9D9G3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chic2Q9D9G3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chic2Q9D9G3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chic2Q9D9G3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chic2Q9D9G3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms