Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc4Q9D844 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms