Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms