Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmigd1Q9D7L8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmigd1Q9D7L8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms