Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap5s1Q9D742 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms