Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufb8Q9D6J5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1164.9 ms