Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip1Q9D620 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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